Атлас Анализ Данных 1000 Геномов

О продукте

Вычислительная платформа, предназначенная для выполнения руководств компании Атлас по работе с данными проекта 1000 Genomes в формате VCF. Платформа содержит все необходимые для выполнения руководств программные пакеты и исходные данные. Схема хранения VCF данных и дополнительных необходимых скриптов указана в текстах руководств к задачам. Функциональные возможности платформы ограничены набором программных предустановленных пакетов (BCFtools, VCFtools, KING, Plink) и могут быть использованы для выполнения любых соответствующих задач.

Примеры использования
  • Конвертация и выделение подмножества VCF файлов.
  • Проведение анализа родственных связей.
  • Проведение анализа главных компонент.
  • Вычисление популяционных аллельных метрик.
  • Проведение полногеномного поиска ассоциаций.
  • Генерация данных генотипирования в формате 23andMe.
Полезные ссылки
Вендор
Atlas Biomed
Категория
Analytics
Версии
Atlas Biomed